Commencé au VIᵉ siècle av. J.-C., le Temple d'Apollon de Naxos était une œuvre ambitieuse, initiée sous la tyrannie de Lygdamis. Inspiré par les temples d'Olympie et de Samos, il devait symboliser la grandeur de l'île.
Cependant, en raison de bouleversements politiques, l'édifice ne fut jamais achevé, et seul subsiste aujourd'hui La Portara, une entrée monumentale vers un sanctuaire légendaire.