Après la culture pré-inca des Paracas, quelques maîtres de royaumes régionaux se sont peu à peu étendus vers les grands espaces de la région andine. C'est le cas des Wari, qui organisèrent la vie dans la vallée de Lima, précisément dans la chaîne montagneuse de Ayacucho située entre Cusco, à l'est, et la côte littorale, au centre. Entre 200 et 600 ap. J.-C., l'importance administrative des "huacas", temples et centres de pouvoir local, fut décisive. Les seigneurs Wari dominèrent cette région centrale durant un millénaire, grâce à des visions stratégiques et des conceptions urbanistiques remarquables, constituées de structures de pierres, de chemins, de tombes, de canaux et de galeries souterraines. Mais ce sont les Incas qui, à partir de l'année 1400, étendirent l'empire et assujétirent les Waris. Ce sont eux encore qui édifièrent la ville de Vilcashuaman en centre administratif. La domination fut sans partage, au moyen de stratégies militaires et de systèmes d'impôts. Surplombant la vallée à 3470 mètres de hauteur, la cité administrative comprend notamment une grange place trapézoïdale, des temples et terrasses en pierres, ainsi que plusieures habitations pour loger les troupes de l'armée inca.