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La répartition des espèces suit les trois grandes zones géographiques du pays avec du nord au sud : la montagne boisée, la steppe et le désert de Gobi. Avec cette diversité d'écosystème, la Mongolie est un véritable laboratoire à ciel ouvert pour les chercheurs scientifiques, d'autant plus qu'elle a créé d'immenses zones de parcs protégées.
? Nomade
Dans l'Altaï, la province de Khovd est fréquentée par des chasseurs étrangers qui viennent pour l'argali, une espèce de mouton sauvage. Autour du lac Khövsgöl, la province la plus boisée du pays, on trouve une faune typique de la taïga montagneuse : cerfs, castors, hermines... Les zones situées à proximité du lac sont d'ailleurs l'habitat de l'ours brun, de l'ibex, de l'argali et de bien d'autres espèces rares. Comme dans certains fleuves du pays, on trouve ici le poisson taïmen, le plus gros saumon du monde qui peut atteindre 2 m et peser 80 kilos. La province centrale, au sud d'Oulan-Bator, possède plusieurs zones protégées. Dans le site des monts Bogdo-Khan qui s'étend à la fois sur la steppe et la forêt, on rencontre beaucoup de cerfs, de biches et de sangliers, particulièrement sur le mont Bogdo-Uul (2 270 m) où des sentiers balisés ont été aménagés pour le trek. La réserve naturelle de Khustïan Nuruu a, quant à elle, été spécialement créée pour la réintroduction du takhi, plus connu sous le nom de cheval de Prjevalski.
? Nomade
Les steppes de Dornod constituent le territoire privilégié de la rare gazelle blanche, du loup et du renard rouge, mais aussi de moustiques particulièrement voraces. C'est en effet la seule zone de Mongolie à posséder une steppe encore à l'état primitif. On y a répertorié plus de 1 000 espèces de plantes, ainsi que des espèces extrêmement rares, comme la grue de Sibérie.
? Nomade
Zone d'études scientifiques, la Grande Reserve du Gobi est unique au monde, car la majorité des animaux et des plantes qu'elle abrite, sont endémiques et s'adaptent particulièrement bien aux conditions extrêmes. Ibex, argalis, léopards des neiges, castors et oiseaux de proie se partagent les territoires montagneux, tandis que les plaines sont le domaine de la gazelle blanche, de l'antilope à queue noire ou d'espèces rarissimes comme le chameau sauvage et l'ours de Gobi. Les plantes présentent ici la particularité de pouvoir être utilisées comme compléments alimentaires. Le saxaoul, le buisson des sables qui fleurit en mai, le karagana dont les racines descendent à plusieurs mètres sous le sol et la rhubarbe font partie de ces variétés spécifiques au Gobi. Quant aux nomades, ils se déplacent à l'aide des chameaux de Bactriane, une race très résistante.
? Nomade
Avec 80 % de son territoire voué au pâturage, le cheptel du pays est de loin supérieur au nombre d'habitants car on l'estime en effet à 31 millions de têtes. Le bétail est essentiel car il fournit le lait, la laine et parfois même la peau et la viande. Chameaux, chevaux, ovins, caprins ou bovins, les nomades mongols ont pris l'habitude de classer le bétail en fonction de signes morphologiques. Par exemple, les grands museaux, petits museaux, jambes courtes...
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