On compte environ 600 espèces végétales, à commencer par le merbau, l'arbre officiel de l'île, utilisé entre autres, pour fabriquer des meubles et des sculptures. Guam est aussi connu pour les flamboyantes fleurs de bougainvilliers et le parfum des frangipaniers et du jasmin. Les arbres fruitiers sont nombreux : papayes, bananes, noix de coco, fruits à pain, mangues, goyaves, limes... Il y a trois jardins botaniques : Inarajan au sud, Nano Fall dans le charmant village de Santa Rita, et la plantation d'ananas à Yigo.