Les Troodos renferment la moitié des espèces endémiques de Chypre. Vous y verrez notamment deux espèces rares : l'agrino, une variété de mouflon aujourd'hui protégée et le faucon d'Eléonore. C'est également la terre de prédilection du cèdre et du grand pin d'Alep. Comme dans beaucoup de pays méditerranéens, vous verrez des troupeaux de moutons et de chèvres, ainsi que quelques espèces d'oiseaux migrateurs qui viennent y faire escale, comme le flamant rose et l'hirondelle. Vous pourriez même croiser une espèce locale de couleuvre mesurant plus de deux mètres de long.
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